Penduduk Indonesia di tahun 2005 diperkirakan sejumlah 241.973.879 jiwa dengan kepadatan rata-rata 134 jiwa per km persegi. Di tahun 2005 pertumbuhan populasinya mencapai 1.5 persen tiap tahun. Turun dari laju pertumbuhan tahunan 1.8 persen sepanjang tahun 1980-an dan relatif rendah dibandingkan negara dengan tingkat pendapatan serupa. Laju pertumbuhan yang relatif rendah sebagian karena pertumbuban ekonomi yang memicu pembentukan keluarga kecil dan sebagian karena keberhasilan program KB yang dijalankan secara aktif oleh pemerintah.

Dengan perkiraan jumlah penduduk 114.733.500 jiwa di tahun 1995, Pulau Jawa didiami oleh lebih dari separuh penduduk Indonesia. Pulau terpadat kedua setelah Jawa adalah Sumatera dengan jumlah penduduk 40.830.400 jiwa. Disusul dengan Sulawesi dengan 13.732.500 jiwa dan Kalimantan dengan 10.470.800 jiwa. Sisanya termasuk Bali dengan 2.895.600 jiwa.

Di awal abad 20 Belanda mulai menjalankan program untuk memindah penduduk dari Jawa ke beberapa tempat di Sumatera. Pemerintah Indonesia sendiri menjalankan program transmigrasi di tahun 1969, memindahkan penduduk dari Jawa ke Sumetera dan pulau-pulau lain seperti Kalimantan, Sulawesi, Maluku, dan Papua. Puncaknya dari tahun 1979 hingga 1984, 535.474 keluarga telah dipindahkan. Tetapi kemudian, biaya dan kendala tempat telah menyebabkan sejumlah transmigran mengalami kegagalan. Program transmigrasi dihentikan sementara di tahun 2000.